Pada tahap ke-3 Program Doktor Biologi (PD1-3), akan dilakukan monitoring kemajuan penelitian mahasiswa. monitoring ini dilakukan pada tengah dan akhir semester. Pada tengah semsester dilakukan dengan pengisian Form Monitoring, sedangkan pada akhir semseter monitoring dilaksanakan melalui pengumpulan laporan penelitian dan bukti publikasi (sesuai ketentuan mata kuliah PD1, PD2 atau PD3) dan Presentasi Kemajuan Penelitian.